随着分子生物学研究进入以蛋白质组学为标志的后基因组时代，蛋白质相互作用成为蛋白质组学研究的一个重要主题。
蛋白质在内的其他生物分子很少独立工作，在相互作用时它们或是迅速从另一个分子表面擦过，或是牢固地结合在一起形成复杂的细胞机器。分子之间相互作用故障会影响人体健康。
蛋白质是生活中比较重要的概念，因为食物当中充满了蛋白质，而且人体每天都需要大量的蛋白质来维持生命的运行，随着现代科学技术的进步，人们对蛋白质的研究越来越深入，出现了微观方面的蛋白质研究成果。
蛋白质与蛋白质之间的相互作用构成了细胞生化反应网络的一个主要组成部分，对调控细胞及其信号有重要意义。
蛋白质互作研究按照实验目的可分为两大类，一是验证两个蛋白是否存在相互作用，二是筛选某个兴趣蛋白的互作蛋白。
生化学家一辈子都致力于研究一个或几个蛋白质之间的相互作用。如今，他们联起手来，正在开发一款从细胞器到有机体尺度的“蛋白质相互作用图谱”。
